Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HADHQ16836 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HADHQ16836 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HADHQ16836 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HADHQ16836 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms