Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDK4Q16654 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms