Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAPC1Q16533 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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