Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK5Q16478 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK5Q16478 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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