Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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GABRA6Q16445 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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GABRA6Q16445 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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