Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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