Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
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