Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEDD8Q15843 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEDD8Q15843 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms