Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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