Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
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NCOA1Q15788 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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NCOA1Q15788 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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NCOA1Q15788 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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NCOA1Q15788 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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NCOA1Q15788 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
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NCOA1Q15788 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
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