Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALX1Q15699 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALX1Q15699 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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