Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1CQ15572 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1CQ15572 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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