Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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PTPAQ15257 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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PTPAQ15257 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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