Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTPRRQ15256 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRRQ15256 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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