Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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