Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GAPVD1Q14C86 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
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