Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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