Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HNF4GQ14541 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms