Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A3Q14050 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms