Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms