Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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GTF2H3Q13889 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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GTF2H3Q13889 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H3Q13889 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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