Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGA9Q13797 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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