Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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