Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P11Q13670 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms