Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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NAE1Q13564 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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NAE1Q13564 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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