Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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