Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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