Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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