Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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