Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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