Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SEMA3BQ13214 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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