Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF1Q13077 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF1Q13077 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms