Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FOXF2Q12947 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FOXF2Q12947 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FOXF2Q12947 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXF2Q12947 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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