Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMAN2Q12907 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms