Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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