Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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