Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD3Q0VAK6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD3Q0VAK6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms