Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELP6Q0PNE2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELP6Q0PNE2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELP6Q0PNE2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELP6Q0PNE2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELP6Q0PNE2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP6Q0PNE2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms