Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCBP1Q09161 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms