Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms