Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB2Q08289 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms