Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TGM3Q08188 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms