Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL9Q07325 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms