Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms