Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LTBQ06643 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LTBQ06643 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LTBQ06643 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms