Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPL2Q05D32 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms