Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN1Q05586 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms