Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNC4Q03721 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms