Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms