Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms